DAFNAE è coinvolto in attività di ricerca di base e applicata in molteplici ambiti inerenti i sistemi agro-ambientali rappresentati da Agronomia, Chimica del Suolo, Scienze Animali, Ecologia, Scienze Ambientali, Entomologia, Scienze e Tecnologie Alimentari, Genetica e Genomica, Microbiologia e Fisiologia Vegetale. DAFNAE aderisce a numerosi centri interdipartimentali: CIRVE, CIRGEO, CIRPAM, CRIBI e CINIDT.